В России обнаружен штамм “омикрон”. Ждать ли подъем волны COVID-19

© REUTERS / Jeenah MoonМобильный пункт тестирования на коронавирус в Нью-Йорке

В России обнаружен штамм "омикрон". Ждать ли подъем волны COVID-19

У двоих россиян, вернувшихся из ЮАР, выявили “омикрон”, сообщает Роспотребнадзор. Новый вариант коронавируса с многочисленными мутациями в самом значимом участке генома обнаружили в конце ноября в странах южной Африки. Он быстро распространяется и, полагают эксперты, способен породить очередную волну пандемии.

Как омикрон попал в Россию

В пятницу, 4 декабря, в Домодедово приземлился самолет с 170 россиянами на борту, вывезенными из ЮАР и Намибии. Из-за вспышки COVID-19, вызванной “омикроном”, авиасообщение с этим регионом прервали. Все прибывшие отправились на двухнедельный карантин в обсерватор в Сергиевом Посаде.

У троих пассажиров — кашель, температура, боль в горле. Среди них писательница Юлия Демина из Ярославля. Как сообщает RT, ПЦР у нее положительный. Врачи сказали, что это “омикрон”. Ее и еще одну семейную пару перевезли в другой обсерватор, в поселок Запрудня на юге Московской области.

В понедельник, 6 декабря, Роспотребнадзор подтвердил, что у двоих прилетевших из ЮАР россиян “омикрон”. Всего положительных тестов пока десять.

Таким образом, Россия попала в список из 38 стран с этим гипермутантом. В данный момент в мире доминирует дельта-штамм, утверждают в ВОЗ. Однако ситуация может быстро измениться.

Где и как распространяется “омикрон”

О новом варианте коронавируса сообщили 24 ноября ученые из ЮАР, выборочно расшифровывавшие геномы возбудителей COVID-19 в округе Цване столичной провинции Гаутенг. Там среди студентов университета Претории произошла вспышка инфекции, и нужно было выяснить, в чем причина.

Сразу обратили внимание на огромное число мутаций у изолята по сравнению с исходным уханьским штаммом — 53. Из них 30 в спайк-белке, что вызывало большое беспокойство. Это могло означать, что вирус стал более заразным.

Геном опубликовали в открытой базе GISAID, ВОЗ включила его в список вызывающих озабоченность штаммов (здесь и далее этот термин означает “вариант”). Ему присвоили собственный идентификатор — B.1.1.52, а позже название линии — “омикрон”.

В России обнаружен штамм "омикрон". Ждать ли подъем волны COVID-19

Ускользает от иммунитета. Ученые раскрыли свойства омикрон-штамма COVID-19

До сих пор все известные заражения “омикроном” за пределами Южной Африки — завозные. Причем в некоторых странах он вызвал вспышки в результате событий суперраспространения, что косвенно свидетельствует о его большей заразности и умении обходить приобретенный иммунитет, в том числе вакцинный. Так, в столице Норвегии Осло после корпоративной вечеринки компании Scatec из 120 гостей заболели более ста, в том числе посетители бара, расположенного этажом ниже. У 13-ти подтвердился “омикрон”: на корпоративе были сотрудники, вернувшиеся из ЮАР.

В Дании в Виборге новым вариантом патогена после вечеринки для старшеклассников заразились 53 человека. Всего в королевстве — 183 инфицированных “омикроном”.

В США он уже в нескольких штатах, причем многие заболевшие участвовали в конференции любителей аниме в конце ноября в Нью-Йорке. Первым вирус выявили у побывавшего там жителя Миннесоты, теперь тестируют все 53 тысячи человек.

В Великобритании число инфицированных “омикроном” удваивается каждые три дня. Возможно, дело в большом количестве ПЦР-тестов, отмечает генетик Дмитрий Прусс. “Но в первом приближении это может означать, что и более высокий уровень вакцинации и ревакцинации в Британии не может затормозить “омикрон”, — указал эксперт в фейсбуке.

Все эти вспышки происходят в странах, где привито большинство населения, на ковид-фри мероприятиях. Сообщают о легких симптомах, которые быстро проходят. Это послужило основанием для разговоров о том, что “омикрон” эволюционировал в сторону меньшей патогенности, стал безвреден. Однако эксперты не спешат с выводами и ждут данные из ЮАР, где вакцинирована всего четверть населения.

Новая волна в ЮАР и происхождение омикрон-штамма

Самые острые вопросы сейчас: насколько серьезное заболевание вызывает “омикрон”, опаснее ли он других вариантов, в частности “дельты”. Первые данные об этом публикует Южноафриканский медицинский исследовательский совет.

За две недели — с 14 по 29 ноября — в клинике Стива Бико в центре округа Цване наблюдали 166 пациентов с подтвержденным коронавирусом. Причем, подчеркивают авторы отчета, у большинства инфекцию выявили попутно: в больницу они попали из-за других недугов. Ковидная пневмония возникла у девяти (все не вакцинированы), только один оказался в реанимации (вакцинирован, но у него хроническая обструктивная болезнь легких), еще четырем потребовалось интенсивное лечение. Десять человек умерли, однако неясно, связано ли это с ковидом.

© ИнфографикаШтаммы “омикрон” и “дельта”: мутации s-белка

В России обнаружен штамм "омикрон". Ждать ли подъем волны COVID-19

Штаммы “омикрон” и “дельта”: мутации s-белка

Ученые перечисляют ключевые индикаторы опасности болезни: смертность, число нуждающихся в кислородной поддержке, реанимации, длительность госпитализации. По этим критериям пока ситуация выглядит неплохо, но медики советуют не слишком обольщаться. “Профиль пациентов может резко измениться по мере поступления данных в следующие две недели. Тогда и сделаем более точные выводы”, — констатируют они.

Аналитик Александр Драган указывает на многочисленные нестыковки в отчете из одного-единственного госпиталя, которые не позволяют делать оптимистичные выводы. Однако кое-что из него можно извлечь. “Есть бессимптомные носители. “Омикрон” протекает в разных формах: от легкой до тяжелой. Люди не умирают и не утяжеляются сразу. В то же время это вовсе не безобидная простуда”, — рассуждает эксперт.

Подъем четвертой волны COVID-19 в ЮАР связывают именно с “омикроном”. Эпицентр — в округе Цване. Заболеваемость там в последние недели растет по экспоненте.

© Fareed AbdullahДанные из округа Цване в ЮАР, эпицентра вспышки, вызванной омикрон-штаммом

В России обнаружен штамм "омикрон". Ждать ли подъем волны COVID-19

Данные из округа Цване в ЮАР, эпицентра вспышки, вызванной омикрон-штаммом

Ученые пока не берутся давать прогнозы. Если “омикрон” вытеснит “дельту”, это хорошо, поделился мнением в фейсбуке генетик Алексей Кондрашов. В таком случае, по его словам: “1. И против “омикрона” нынешние вакцины должны неплохо работать. 2. Видообразования вируса пока не произошло”. Худший сценарий — если появится несколько разновидностей возбудителей ковида. “Против каждого надо отдельно прививаться, и каждый независимо эволюционирует куда-нибудь”, — поясняет специалист.

Весьма обстоятельный анализ представили (в виде препринта) 5 декабря биоинформатики из ЮАР, открывшие “омикрон”.

1/18 "Selection analysis identifies significant mutational changes in Omicron that are likely to influence both antibody neutralization and Spike function" https://t.co/5OxhwEt7mL @DarrenM98230782 @Tuliodna @jbloom_lab @robertson_lab @nekrut @LemeyLab and many others.

— Sergei Pond (@sergeilkp) December 5, 2021

Они исследовали изменения в спайк-белке и обнаружили три кластера мутаций, включающие 13 аминокислот из очень консервативных участков. В подсемействе коронавирусов, к которому принадлежит SARS-CoV-2, раньше их не было. По мнению ученых, эти мутации неслучайны, они позволяют вирусу быстрее распространяться и обходить вируснейтрализующие антитела, сформированные инфекцией. Так вирус адаптировался.

Однако где и как он возник, неизвестно. Есть три гипотезы. Возможно, его просто пропустили, потому что с мая по сентябрь в Южной Африке мало тестировали. Или он эволюционировал в хронически больном ковидом человеке или группе людей. Такое не исключено, в частности, у пациентов с ослабленной иммунной системой. Третий путь — обратный перескок от каких-то животных. Они заразились от человека в пандемию, вирус в них мутировал и снова вернулся к человеку.

© Иллюстрация РИА НовостиЭволюция вируса SARS-CoV-2

В России обнаружен штамм "омикрон". Ждать ли подъем волны COVID-19

Эволюция вируса SARS-CoV-2

Источник: ria.ru

Добавить комментарий

*

16 − 12 =